Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sh3bp1P55194 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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