Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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