Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms