Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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DmdP11531 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DmdP11531 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DmdP11531 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DmdP11531 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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