Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01645 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01645 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms