Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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