Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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