Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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