Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms