Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms