Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phc2Q9QWH1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phc2Q9QWH1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phc2Q9QWH1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms