Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rabgef1Q9JM13 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rabgef1Q9JM13 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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