Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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