Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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