Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms