Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cldn22Q9D7U6 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Cldn22Q9D7U6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cldn22Q9D7U6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms