Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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