Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rims1Q99NE5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rims1Q99NE5 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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