Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf17Q99MV7 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf17Q99MV7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf17Q99MV7 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms