Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms