Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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