Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf144aQ925F3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf144aQ925F3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf144aQ925F3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf144aQ925F3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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