Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms