Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ChfrQ810L3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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