Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc29Q80VM3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms