Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms