Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ClmQ7TSN2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms