Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tmeff1Q6PFE7 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms