Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms