Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms