Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arhgef40Q3UPH7 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms