Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
InipQ3TXT3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms