Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms