Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms