Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms