Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms