Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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