Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TP20293 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TP20293 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TP20293 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms