Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
DmdP11531 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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DmdP11531 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms