Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms