Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Srp72F8VQC1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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