Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 2010009K17Rik-201ENSMUST00000186977 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms