Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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