Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms