Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hacd4A2AKM2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms