Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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