Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrit3W8DXL4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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