Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm28036V9GXJ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28036V9GXJ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms