Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm4T1NXB5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms