Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top3bQ9Z321 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top3bQ9Z321 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms